TAXILA GLOBAL SCIENTIFIC LITERATURE TEXT-MINING INTELLIGENCE FOR ONCOLOGY RESEARCH

03.12.2021 r. | 16:00
BEZPŁATNE WARSZTATY ONLINE

Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego (ICM) Uniwersytet Warszawski we współpracy z The Systems Biology Institute (SBI) w Tokio zaprasza na warsztaty z wykorzystania frameworku Taxila.

Zajęcia są skierowane do pracowników naukowych, lekarzy i badaczy zajmujących się dziedziną onkologii. ICM UW jako jedyna jednostka na świecie zainstalowała system informatyczny Taxila pozwalający automatycznie analizować teksty z setek tysięcy artykułów naukowych. Pierwsze warsztaty są specjalnie zaprojektowane dla badaczy zajmujących się onkologią.

Polecamy wykład Hiroaki Kitano, twórcy Taxili, pt. „Nobel Turing Challenge – Creating the Engine of Scientific Discovery” z konferencji Supercomputing Frontiers Europe 2021

Dowiedz się więcej…



Workshop overview: The purpose of this workshop is to acquaint attendees with the toolset of Taxila – textmining intelligence deployed on ICM system in collaboration with The Systems Biology Institute (SBI) in Tokyo.Particular focus of this workshop will be text-mining and potential hypothesis generation for oncology research, based on the possibly entire global corpus of scientific literature in this domain. Taxila is an AI-driven framework enabling advanced big-scaled text analysis and its conversion into useful scientific insight. In particular, given an access to a huge database of scientific publications, Taxila allows to develop an understanding between various concepts presented in the papers via several tools as tag analysis, concept correlation or graph visualisation [1]. This is the first workshop organised jointly by ICM and SBI, a new collaborative initiative where SBI brings Taxila and ICM contributes, among other things, with the corpus of scientific literature forming ICM Virtual Library of Science – a full-text collection of over 160 thousand of scientific books and over 26,000 scientific journals. The workshop will be led by SBI team with its thematic focus on oncological diseases.

Planned outcome: After the workshop the participants should be able to search in the scientific database for their points of interest via Taxila.

Date: 3rd December 2021 – Taxila methodology and tools [2]
Time: 4:00 PM (GMT+1)
Duration: 3 hours

Instructors: Samik Ghosh, Ayako Yachie (tentative), Suchee Kumar Palaniappan

Participants:
▪ Scientists, researchers and doctors in the field of oncology;
▪ Max number of participants: 20

References and notes:
[1] Akujuobi U., Spranger M., Palaniappan S.K., Zhang X. 2020 T-PAIR: Temporal Node-pair
Embedding for Automatic Biomedical Hypothesis Generation IEEE Transactions on Knowledge Sand
Data Engineering

[2] Second, follow-up session with much richer corpus of scientific texts will be run in January 2022

 

Mapa niedostępna

Registration FormFormularz rejestracyjny

Rejestracja na to wydarzenie nie jest już dostępna